Buenos días,
Actualmente tengo instalados 8 servidores FTP en Windows Server 2012/2016 sobre Microsoft Azure en la empresa en la que laboro, por lo cual el proceso lo tengo bien documentado.
Unicamente se requiere acceso a la consola de Azure, que definamos la máquina que vamos a levantar en Azure, especificaciones básicas:(vcpus/memoria/s.o./tamaño de discos, etc.
Podemos restringir la seguridad con Networks Security Groups para que únicamente se pueda accesar al servidor FTP por un rango de IPs Publicas establecido.