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Review
. 2020 Aug;39(2):481-490.
doi: 10.20506/rst.39.2.3099.

Genomics and climate change

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Review

Genomics and climate change

C M McManus et al. Rev Sci Tech. 2020 Aug.
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Abstract

Climate change is predicted to change the nature and distribution of global farming systems, and strategies will be needed to adapt and optimise global food-producing systems. If genomic technologies are to be useful in this scenario, there is a need for the careful definition of phenotypes and routine sample collection, as well as large-scale genotyping of animal populations. Genomic tools will greatly enhance the characterisation of available germplasm and exploration of local genetic resources, while faster and cheaper DNA sequencing is leading to an increased understanding of the underlying genetic basis of traits. The use of genomic tools to increase animal resilience, reduce methane emissions from cattle and sheep, improve disease resistance, decrease environmental impact, reduce competition for land and water and, finally, increase production may be the most feasible path for the future of livestock production. In this review, the authors discuss various genomic strategies in the light of climate change, focusing on the selection of resistant/tolerant animals, landscape genomics, metagenomics and gene editing.

L’un des effets anticipés du changement climatique sera la modification de la nature et de la distribution des systèmes d’élevage dans le monde, raison pour laquelle des stratégies seront nécessaires pour adapter et optimiser les systèmes mondiaux de production alimentaire. Si l’on veut que les technologies de la génomique soient utiles dans ce scénario, il faudra procéder avec soin à la définition des phénotypes et à la collecte de routine des échantillons, et réaliser le génotypage à grande échelle des populations animales. Les outils génomiques permettront d’améliorer nettement la caractérisation du germoplasme disponible et d’effectuer une exploration plus approfondie des ressources génétiques locales, tandis que le séquençage ADN devenu plus rapide et meilleur marché se traduira par une meilleure compréhension de la base génétique sousjacente des caractères. Le recours à des outils génomiques pour augmenter la résilience animale, réduire les émissions de méthane du cheptel bovin et ovin, améliorer la résistance aux maladies, diminuer l’impact environnemental, réduire la concurrence pour les terres et les ressources hydrographiques et, enfin, accroître la production pourrait être la voie à suivre la plus réaliste pour l’avenir de la production animale. Les auteurs examinent plusieurs stratégies génomiques à la lumière du changement climatique, en se concentrant sur la sélection des animaux résistants/tolérants, sur la génomique du paysage, sur la métagénomique et sur l’édition génomique.

Según apuntan las predicciones, el cambio climático va a modificar la naturaleza y la distribución de los sistemas agropecuarios del mundo y por doquier en el planeta harán falta estrategias destinadas a adaptar y optimizar los sistemas de producción de alimentos. Para que las herramientas de la genómica sean útiles, en caso de que efectivamente se cumplan estos augurios, es indispensable disponer de detalladas caracterizaciones fenotípicas, muestreos sistemáticos y tipificaciones génicas a gran escala de las poblaciones animales. Las herramientas de la genómica mejorarán mucho la caracterización del germoplasma existente y el estudio de los recursos genéticos locales, a la vez que la secuenciación de ADN, cada vez más rápida y barata, nos aporta ya un conocimiento más profundo de la base genética de los rasgos fenotípicos. Quizá el camino más practicable para el porvenir de la producción ganadera sea el que pasa por utilizar las herramientas de la genómica para conferir más resiliencia a los animales, reducir las emisiones de metano del ganado vacuno y ovino, mejorar la resistencia a enfermedades, atenuar el impacto ambiental, reducir la competencia por los suelos y el agua y, por último, incrementar la producción. Los autores examinan una serie de estrategias genómicas desde la óptica del cambio climático, centrándose en la selección de animales resistentes o tolerantes, la genómica de paisajes, la metagenómica y la edición génica.

Keywords: Climate change; Gene editing; Genome selection; Landscape genetics; Livestock production; Metagenomics; Methane emissions.

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