Департамент науки и инноваций (НИ) использует возможности глобального исследовательского сообщества для углубления знаний о системе Земля, совершенствования актуальных с точки зрения проводимой политики научных знаний и повышения ценности науки для предоставляемого обслуживания. Директором Департамента НИ и главным научным сотрудником ВМО является проф. Юрг Лутербахер.
Департамент НИ выполняет следующие функции: